L Corporation の地下施設は、カバラの生命の樹（Sephiroth Tree）に対応する 10 の部門で構成されている。 各部門にはセフィラと呼ばれる管理 AI が配属され、彼らはそれぞれの部署の "歪み" を体現している。 本書は、各セフィラの抱える歪みと、ストーリー進行で繰り返されるコア抑制（Core Suppression）の意味を、 ネタバレを最小限に抑えて並べ直す。
本ページは "存在することの紹介" にとどめ、各部署の固有エピソードや AI の正体に関する展開には踏み込まない。 初見プレイの体験を保つ構成を意図しています。
セフィラの数は 9 体だが、中央指令部（Central Command）の Tiphereth は A・B の対構造を取る設計のため、 部門の総数は 10 となる。各部門は施設の階層と機能で分かれており、上層に近づくほど "施設全体に対する責任の比重" が増す。
本作のストーリー進行は、特定の日に発生する Sephirah Meltdown（セフィラ暴走）と、 部門ごとに用意される Core Suppression（コア抑制）という2つの構造を中心に回る。
メルトダウンは、複数のアブノーマリティが同時に暴走する 制御不能の局面を意味する。管理人はこの事象を 事前に対策できる側に立つことで、被害を最小限に抑える運用判断を求められる。
コア抑制は、特定のセフィラが管理する部門で発生する 固有のエンカウントである。 各セフィラのコア抑制を完遂することは、その部門の "歪み" と向き合うことと同義であり、 物語上の節目として扱われる。
Lobotomy Corporation の物語は、Project Moon の一連の作品群（Library of Ruina / Limbus Company）へと続く都市世界の起点であり、 本作で語られる小さな選択の数々は、後続作品で具体的な人物・組織として再登場する伏線を多く含んでいる。
本 Wiki では、初見プレイの体験を尊重し、具体的なエピソードの結末・キャラクターの真相・固有名詞の意味については、 各セフィラ専用ページが完成し次第、ネタバレ警告付きで個別に公開していく方針を取る。 現時点では "存在の地図" のみを提供する。
※ 各セフィラの固有エピソード・コア抑制攻略・キャラクター考察は、本 Wiki 内の各個別ページで順次公開する。